Localizado no Alto de Santo Antônio da Barra, atual bairro de Vitória, em Salvador, no litoral do Estado da Bahia.

Esta estrutura ergue-se no local onde anteriormente havia existido o Castelo do Pereira. Protegido pelo Morro de Santo Antônio, do lado direito da praia do Porto da Barra, junto à Santa Casa de Misericórdia, o Forte de São Diogo visava impedir, com o apoio do Forte de Santa Maria, o desembarque inimigo naquele acesso ao sul de Salvador, na Cidade Baixa.

Sua construção remonta 1609-12 com planta do Engenheiro-mór e dirigente das obras de fortificação do Brasil, Francisco de Frias da Mesquita (1603-34). Figura na "Planta da cidade de Salvador" (João Teixeira Albernaz, 1616) como Estância de São Diogo.

Foi reconstruído a partir de 1626, durante o Governo Geral de Diogo Luís de Oliveira (1626-35), resistindo, ainda em obras, ao ataque de abr-mai/1638 do Conde Johan Maurits van Nassau-Siegen (1604-79).

Sofreu alterações na estrutura e no traçado a partir de 1704, que lhe conferem a atual estrutura orgânica (o seu terrapleno acompanha a linha da base do morro, cortado para a sua edificação). É inaugurado em 1722, quando passa a contar com uma bateria de sete peças de artilharia. De acordo com as Cartas Topográficas das fortalezas da Bahia, de José Antônio Caldas (c. 1764), tem o traçado de um meio reduto circular com edificação de dois pavimentos abrigando as dependências de serviço do forte (Casa de Comando, Quartel da Tropa, Casa de Palamenta, e outras) pelo lado do mar. Barreto (1958) computa a sua guarnição como sendo um Capitão comandante e dois soldados artilheiros, estando artilhada com duas peças de bronze de calibre 8 libras e cinco de ferro de calibre 12 lb.

Em 1863, bem conservado, mantinha cinco peças de 24 libras a serviço do Império. Passou por novas reformas, nas bases para os canhões e parapeitos, em 1875, 1883 e 1886 (Barreto, 1958). Souza (1885) informa que mantinha, à época, quatro peças de artilharia, abandonadas.